Ну если сравнивать с Вашими главным конкурентом:
1) они без проблем переносят все кастомное ПО вместе с пользователями с сервера на сервер.
2) bash_history можно удалять, но насколько я знаю все логи у них есть.
3) таких проблем не было.
4) В этом вопросе как говориться - кто как горазд =)